東京國際機場有兩個：成田機場和羽田機場。成田距離市中心較遠，羽田機場則在市區內。
成田機場進市區的交通方式
巴士選擇：
- 利木津巴士和京成巴士 – 巴士路線多且會停靠各大酒店，適合行李多的旅客，但價格較高。有巴士前往河口湖/富士山站。
- LCB巴士 – 票價1300-1900日元，可到池袋、涉谷、銀座等地，路線選擇較少。
電車選擇：
- JR NEX成田特快 – 單程3250日元，網上預訂或自動賣票機購買。速度最快、票價最高，適合前往新宿、涉谷或橫濱的旅客。
- 京成本線 – 有三種車種可選：
- Skyliner：直達上野、日暮里站，車程約41分鐘，單程2300日元，全座位預約。
- Access特急：停站較多，約59分鐘到上野，單程1270日元，地鐵一日券可以搭。
- 快急特急／特急：類似一般地鐵，車程約70-85分鐘，單程1030日元，適合行李輕便，不趕時間的旅客。
羽田機場進市區的交通方式
電車選擇：
- 東京單軌電車 Monorail
由JR經營，前往濱松町JR站最快13分鐘，從這裡再換JR山手線到各站。
車票到濱松町是520日元，班次多，適合住靠近JR站的遊客。
缺點：比京急電鐵貴，不過如果週末或假日抵達，就有優惠票：搭單軌電車從羽田到山手線任何一站下車，單程只要540元，購買處：羽田機場自動售票機。 - 京急電鐵
到品川站最快11分鐘，車票330日元，到淺草也是600多元。和都營淺草線相連，不用轉車就可前往淺草線的各站。不用轉車可以去到橫濱站（400日元）購買：刷西瓜/pasmo/icoca卡即可
Metro地鐵很多站都可以轉不同的電車，很便利，車費也比較便宜，適合住在Metro地鐵站附近的遊客。
套票：京急電鐵（機場來回）+ 都營&東京 metro 24/48/72地鐵卡
包含羽田到品川泉岳寺或橫濱之間的京急線，以及都營和東京metro所有線
票價：1400/1800/2100日元
有效期間：9天
購票處：只能在羽田機場第三航廈的京急電鐵旅客服務中心，或上JAL/ANA 網站購買。其實套票價格差不大。
巴士選擇：
利木津巴士 – 票價較貴。如果去迪士尼就建議搭巴士直達飯店。
東京三大鐵路公司
1）JR：電車通常走在路面，其中遊客最常用的是山手線。山手線以環狀運行，需要注意的就是內環和外環。從成田坐skyliner到日暮轉搭山手線最方便。
內環（逆時針）：新宿→澀谷→品川→東京的順序
外環（順時鐘）：東京→品川→澀谷→新宿的順序
山手線（LOGO是JY+號碼）有以下重要的站：
- 上野：成田機場、新幹線轉換
- 東京車站：新幹線、搭巴士去河口湖、迪斯尼(轉JR京葉線）
- 新橋：轉乘海鷗線去台場、豐州
- 品川：羽田機場
- 涉谷
- 新宿：吉祥寺(轉JR中央線）『特別快速』不停吉祥寺！要注意！請乘坐快速電車
- 池袋
中央線：從東京東部東京車站橫跨到新宿，比山手線快很多
都營地下鐵
含4線：淺草線、大江戶線、三田線、新宿線。通常和地下鐵 Tokyo Metro 合用車站
淺草線：押上（晴空塔）、淺草、新橋等。這條線的都營車過了押上站後會上京成電鐵，直達成田。另外也可以直達羽田機場，都營車過了泉岳寺站，會轉去品川，部分列車會直接到京急電車的羽田機場站。
新宿線：新宿、九段下（千鳥之淵），連接東西區
大江戶線：是一條從新宿繞一大圈回到（新宿）都廳前站。途徑六本木、赤羽橋（東京鐵塔）、築地市場、上野、新宿西口（歌舞伎町）
東京地下鐵 Tokyo Metro
含9條路線（銀座線、副都心線、千代田線、日比谷線 、丸之內線 、有樂町線、半藏門線、東西線、南北線），遊客最常用的有：
日比谷線：去上野、人形町、茅場町、秋葉原、築地、銀座、神谷町（麻布hills）、六本木、惠比壽、中目黑（轉東急東橫線），是一條類似銀座線但更長。
丸之內線：去池袋、新宿、銀座、東京車站（新大阪、名古屋），後樂園（東京巨蛋)，橫跨東西區
銀座線：去淺草、上野、日本橋、銀座、青山一丁目（明治神宮）、表參道、涉谷，是很適合遊客的一條線。
千代線：大手町（靠近東京車站）、明治神宮前（原宿）、代代木公園，這條線走到總站會直接開上小田原線，去到下北澤。
近郊其他鐵路東京三大鐵路公司
東京近郊也有一些私人鐵路公司提供交通服務：
- 小田急線：從新宿到下北澤、箱根、江之島等地。
- JR富士回遊：從新宿開往富士山、河口湖。一日只有幾個班次。
適合遊客的交通券推薦
JR PASS 推薦方案
1. JR東京廣域周遊券
這張周遊券適合規劃在東京及其周邊地區旅行的旅客。票價為 15,000 日元，有效期為 連續 3 天。不過需注意，無法搭乘京王線和小田急浪漫特快線。
2. JR東日本鐵路周遊券（東北區）
適合想探索東北地區的旅客，包含了成田與羽田機場至東京，以及東北各大城市的交通：
- 價格：30,000 日元
- 有效期：連續 5 天
- 可無限次搭乘東京市區的 JR 線，成田、羽田機場，前往秋田、山形、青森、仙台等東北城市。
3. JR東日本鐵路周遊券（長野、新潟區）
適合想要探索長野、新潟地區的旅客。
- 票價：27,000 日元
- 有效期：連續 5 天
- 可無限次搭乘東京市區的 JR 線，成田、羽田機場，前往長野和新潟等地。
4. 北路拱形鐵路周遊券
這張周遊券適合從東京或關西地區出發的旅客，前往北路的熱門景點。
- 票價：25,500 日元
- 有效期：連續 7 天
- 適合旅遊路線包含金澤、福山、敦賀站，並包含成田、羽田和關西機場的交通，方便旅客探索北陸地區。
適合市區的交通券推薦
東京一日券 – 1600日元
- 優點：無限次搭乘JR、東京地鐵、都營及其他私鐵，在市區通行無阻。
- 缺點：適合行程較滿的旅客，一天最好跑四個景點以上，才能發揮票券的價值。
TOKYO SUBWAY TICKET – 800、1200、1500日元
- 優點：提供 24、48、72 小時的選擇，第一次過站後才開始計時，可以使用東京metro和都營全部十三條地鐵，靈活方便。坐三趟地鐵馬上回本。
- 缺點：不能搭 JR 電車，若住在山手線附近或需頻繁使用 JR 則不適合。
- 購票：以前只能在機場、特定的BIG CAMERA、LAOX店購買，現在多了很多方法，詳情參考官網。也可以網上透過klook / KKday，憑QR code在地鐵自動販賣機兌換車票，不過並非每個地鐵站都有取票機，需參考官網。
- 成田機場第一航廈1F南翼，一出關的對面“京成巴士賣票櫃台”，跟賣利木津巴士/京成巴士同一櫃檯。第2航廈1層大廳（ARRIVAL HALL）的“京成巴士賣票櫃台”。
東京 Metro 地鐵 24 小時乘車券 – 600日元
- 優點：價格便宜，非常適合行程集中在 淺草、涉谷、新宿、池袋、東京車站、六本木、秋葉原等地。
- 缺點：僅限 Tokyo Metro 地鐵，無法搭乘其他路線。